Das schlankste NGS-Kit mit nur 30 Minuten praktischer Zeit für 96 Proben.
100% automatisierbar mit nur einem einzigen PCR-Schritt und ohne die Notwendigkeit einer Normalisierung.
Die Echtzeit-PCR ermöglicht eine absolute Quantifizierung der mikrobiellen Kopienzahl.
BESCHREIBUNG
Das Quick-ITS Plus NGS Library Prep Kit ist die schnellste und einfachste NGS-Bibliotheksvorbereitung für die ITS-Region für die Hochdurchsatzsequenzierung. Das automatisierungsfreundliche Protokoll verwendet eine einzige qPCR/PCR für die kombinierte gezielte Amplifikation und Barcode-Addition unter Verwendung speziell entwickelter Primer. Nach dem Pooling in gleichen Volumina wird ein einziges Clean-up der endgültigen Bibliothek durchgeführt, anstelle von massiven AMPure® Bead-basierten Clean-ups. Zusätzliche Analysen zur Quantifizierung der Bibliothek, wie z. B. die TapeStation®-Analyse oder Gelelektrophorese, sind nicht erforderlich. Mit diesen Funktionen reduziert der Arbeitsablauf den Zeitaufwand für die Bibliotheksvorbereitung drastisch auf nur 30 Minuten.
Amplikongröße - Die endgültige Amplikongröße nach der 1-Schritt-PCR (gezielte Amplifikation und Barcode-Addition) beträgt ~480 bp.
Barcode-Sequenzen - 10 bp-Barcodes, die hier (nur in den USA) oder im Abschnitt Dokumente als "Barcode-Sequenzen" zum Download zur Verfügung stehen.
Index-Primer - Dualer Index (Barcodes) zur eindeutigen Kennzeichnung von Proben.
ITS Primer Sequenzen - (Adapter nicht enthalten)
ITS3f (GCATCGATGAAGAACGCAGC, 20 bp), ITS4r (TCCTCCGCTTATTGATATGC, 20 bp).
Erforderliche Ausrüstung - Mikrozentrifuge, Plattenschleuder (Zentrifuge), quantitatives 96-Well-Echtzeit-PCR-System (SYBR Green-kompatibel) oder Standard-PCR-System und 96-Well-Echtzeit-PCR-Platten.
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