Reagenzkit / als Lösung Zymo-Seq ATAC

Gewebezur Vorbereitung von ADN-Banken

Sofort einsatzbereit: Vorgefertigte Puffer ermöglichen eine blitzschnelle Bibliotheksvorbereitung in nur 4 Stunden ohne Qualitätseinbußen. Verbesserte Leistung: Präparieren Sie Bibliotheken mit 7-fach geringerer mitochondrialer Kontamination, sparen Sie Reads und erhöhen Sie die Sequenziertiefe. Hervorragende Konsistenz: Erzeugen Sie hochkorrelierte Replikate aus frischen und gefrorenen Proben. BESCHREIBUNG Das Zymo-Seq ATAC Library Kit bietet einen einfachen und optimierten Arbeitsablauf für die Vorbereitung von ATAC-Seq-Bibliotheken (Assay for Transposase Accessible Chromatin with high throughput Sequencing) aus Säugetierzellen und -gewebe. Dieses All-inclusive-Kit verfügt über ein einfach zu befolgendes Protokoll, mit dem ATAC-Seq-Bibliotheken aus bis zu 50.000 Zellen in nur 4 Stunden und mit minimalem Zeitaufwand vorbereitet werden können. Die anfängliche Zelllyse ist sanft und stellt sicher, dass die wichtigen Zellkerne aus der lysierten Zelle herausgeschleudert und gesammelt werden, während die kontaminierende mitochondriale DNA in der Zelle verbleibt und entsorgt wird. Als Nächstes fragmentiert und markiert (taggt) die mit Illumina-Adaptern beladene Transposase in einer schnellen Reaktion gleichzeitig offene Chromatinregionen. Schließlich wird die getaggte DNA indiziert und mittels PCR mit dem UDI-Tag-Primer-Set amplifiziert, wodurch qualitativ hochwertige Bibliotheken entstehen, die auf jedem Illumina-Instrument sequenziert werden können. DNA-Input - Für optimale Ergebnisse sollten Sie 50.000 Zellen pro technischem Replikat verwenden. Die Zellen sollten eine Lebensfähigkeit (Maß für den Anteil lebender Zellen innerhalb einer Population) von >80% aufweisen. Wir empfehlen die Verwendung eines Zellzählers, um die Lebensfähigkeit genau zu messen. Erforderliche Ausrüstung - Mikrozentrifuge, Biosicherheitsschrank, Zellzähler, Wasserbad, Thermocycler,