Schnell: 8x weniger Zeitaufwand als bei herkömmlichen 16S-Bibliotheksvorbereitungsprotokollen.
Einfach: Vorgemischte Platte minimiert den Zeitaufwand und Handhabungsfehler.
Einfacher Arbeitsablauf: 100% automatisierbar mit nur einem einzigen PCR-Schritt und ohne Normalisierung. Poolen Sie einfach nach gleichem Volumen!
BESCHREIBUNG
Das Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) ist die schnellste und einfachste NGS-Bibliotheksvorbereitung für die V4-Region des 16S rRNA-Gens für die Hochdurchsatzsequenzierung. Das automatisierungsfreundliche Protokoll verwendet eine vorgemischte Amplifikationsplatte und eine einzige qPCR/PCR für die kombinierte gezielte Amplifikation und Barcode-Addition. Pooling nach gleichem Volumen und ein einziges Clean-up der endgültigen Bibliothek anstelle von massiven AMPure® Bead-basierten Clean-ups vereinfachen den Prozess der Bibliotheksvorbereitung. Zusätzliche Analysen zur Bibliotheksquantifizierung, wie z. B. die TapeStation®-Analyse oder Gelelektrophorese, sind nicht erforderlich. Mit diesen Funktionen reduziert der Arbeitsablauf den Zeitaufwand für die Bibliotheksvorbereitung drastisch auf nur 30 Minuten.
Amplikongröße - Die endgültige Amplikongröße nach der 1-Schritt-PCR (gezielte Amplifikation und Barcode-Addition) beträgt ~388 bp.
Benötigte Ausrüstung (vom Benutzer bereitgestellt) - Mikrozentrifuge, Plattenschleuder (Zentrifuge), quantitatives 96-Well-Echtzeit-PCR-System (SYBR Green-kompatibel empfohlen) oder Standard-PCR-System und 96-Well-Echtzeit-PCR-Platten.
Indexsequenzen - 10 bp-Indizes sind in der mitgelieferten MiSeq-Probenblattvorlage aufgeführt.
Probeninput - Gereinigte mikrobielle DNA (≤100 ng), frei von PCR-Inhibitoren.
Sequenzierungsplattform - Kompatibel mit allen Illumina®-Sequenzierungsplattformen unter Verwendung benutzerdefinierter Sequenzierungsprimer. Wir empfehlen das MiSeq® Reagent Kit v2 (300 Zyklen).
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