Whole Genome Bisulfite (WGBS) Bibliotheksvorbereitung in weniger als 4 Stunden und in einem Röhrchen.
Geringere Verzerrungen bei der Bibliotheksvorbereitung für präzises Methylierungs-Calling
Reproduzierbare Genomabdeckung von jeder Spezies (>90% der CpG-Stellen in Säugetierproben nachgewiesen)
BESCHREIBUNG
Das Zymo-Seq WGBS Library Kit ist das einzige Kit, das für die Vorbereitung von Whole Genome Bisulfite (WGBS) Bibliotheken in einem einzigen Röhrchen erhältlich ist. Das Zymo-Seq WGBS Library Kit beinhaltet die Tagmentierungstechnologie, um die mühsamen Fragmentierungs-, Enzym- und Reinigungsschritte zu eliminieren, die bei herkömmlichen, ligationsbasierten Bibliothekspräparationsmethoden erforderlich sind. Dieser rationalisierte Arbeitsablauf minimiert den Zeitaufwand und macht es zu einer idealen Wahl für Anwendungen mit höherem Durchsatz. Zur Vorbereitung von Zymo-Seq WGBS-Bibliotheken wird intakte genomische DNA zunächst bisulfitiert. Dann werden die folgenden Bibliotheksvorbereitungsverfahren in einem einzigen Röhrchen durchgeführt: (1) Zweitstrangsynthese, (2) Adapterisierung durch Tagmentierung und (3) Bibliotheksamplifikation und Indexierung. Nach der Aufreinigung sind die Bibliotheken bereit für die Sequenzierung auf Illumina-Geräten.
WGBS ist der Goldstandard für DNA-Methylierungsstudien, da es eine Quantifizierung der Methylierung auf Basenebene für alle Cytosine liefert. Das Zymo-Seq WGBS Library Kit ist ideal für alle Spezies für das Methylierungs-Calling von CG-, CHG- und CHH-Stellen im gesamten Genom. Über 90 % der CpG-Stellen von Mensch und Maus können mit Zymo-Seq-Bibliotheken nachgewiesen werden.
DNA-Input - Für optimale Ergebnisse sollten Sie 100 ng intakte genomische DNA von hoher Qualität als Input verwenden. Das Protokoll ist kompatibel mit Inputs zwischen 10 ng und 100 ng. Die DNA sollte frei von enzymatischen Inhibitoren und RNA-Kontaminationen sein. Die DNA kann in Wasser, TE oder einem salzarmen Puffer resuspendiert werden.
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