Reagenzkit / als Lösung Zymo-Seq

zur Vorbereitung von ADN-BankenDNA

Optimiert für die Eingabe kleiner Fragmente: Ideal für kleine und beschädigte DNA-Fragmente wie zellfreie DNA (cfDNA). Präzises Methylierungs-Calling: Das auf direkter Ligation basierende Protokoll ermöglicht genaue Reads und Methylierungs-Calling von nativen Termini für jedes DNA-Fragment. Rationalisierter und einfacher Arbeitsablauf: Erstellen Sie robuste Methyl-Seq-Bibliotheken in nur 3 Schritten. BESCHREIBUNG Das Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit bietet einen optimierten und zuverlässigen Arbeitsablauf für die Vorbereitung von Whole Genome Bisulfit Sequenzierung (WGBS) Bibliotheken aus zellfreier DNA (cfDNA). Dieses All-inclusive-Kit bietet ein unkompliziertes Verfahren, mit dem hochwertige Methyl-Seq-Bibliotheken aus nur 5 ng cfDNA hergestellt werden können. Der Prozess wird in drei grundlegenden Schritten durchgeführt: Bisulfit-Konvertierung, direkte Adapter-Ligation und Index-PCR-Amplifikation. Die anfängliche Bisulfit-Behandlung ist schonend für die cfDNA, wandelt jedoch alle unmodifizierten Cytosine in Uracil um. Anschließend werden die Illumina-kompatiblen Adapter mit den innovativen Splinted Adaptern eingefangen und direkt an DNA-Fragmente beliebiger Größe ligiert, was die Sequenzierung von eingekerbten, beschädigten und kurzen DNA-Fragmenten ermöglicht, die bei herkömmlichen Bibliotheksvorbereitungsmethoden möglicherweise verworfen worden wären. Durch die direkte Ligation der Adapter entfällt auch die Notwendigkeit der Zweitstrangsynthese, der Reparatur der Enden und der dA-Tailing-Schritte, wodurch Verzerrungen durch die Erhaltung der Integrität der nativen Methylierung, die an den Fragmentenden vorhanden ist, reduziert werden. Schließlich wird die adapter-ligierte cfDNA indiziert und über PCR mit Zymo-Seq UDIs amplifiziert, wodurch Bibliotheken erzeugt werden, die für die Sequenzierung auf jedem Illumina-Instrument bereit sind. Barcode-Sequenzen - Bitte beachten Sie den Abschnitt Dokumente.