Das Hieff NGSTM MaxUp Human rRNA Depletion Kit (rRNA & ITS/ETS) wurde entwickelt, um rRNA und 45S ITS/ETS aus Gesamt-RNA von Mensch, Maus und Ratte auf der Grundlage eines RNase H-basierten Arbeitsablaufs zu entfernen und mRNA und andere nicht codierende RNA zu erhalten. Dieses Kit ist sowohl für intakte als auch für teilweise degradierte RNA-Proben (z. B. FFPE-RNA) geeignet. Da degradierte FFPE-Proben in der Regel einen höheren Anteil an ITS/ETS enthalten als frische Gewebeproben, fügt dieses Kit Sonden in der humanen 45S ITS/ETS-Region hinzu, und die Entfernung von ITS kann den Anteil gültiger Daten in den Rohdaten deutlich erhöhen.
Merkmale
Hohe Spezifität: spezifische Entfernung von rRNA und ITS/ETS aus humanen Proben, insbesondere bei FFPE-Proben
Hohe Kompatibilität der Ausgangsmenge der Vorlage: geeignet für 100 ng~1μg Probe
Hoher Entfernungseffekt: für rRNA, ITS und ETS in Proben von Mensch, Maus und Ratte beträgt der Entfernungseffekt mehr als 95%
Stabile Qualität: strenge Qualitätskontrolle der Chargenleistung und Stabilität
Anwendungen
Genexpressionsforschung
Analyse des alternativen Spleißens
Nachweis und Entdeckung von nicht kodierender RNA
identifizierung von selektiven Polyadenylierungsstellen
Nachweis von Fusionsgenen
Spezifikationen
Verarmungstechnologie - RNase H
Probentyp - Gesamt-RNA von Mensch, Maus und Ratte
Endprodukttyp - mRNA und andere nicht kodierende RNAs
Anzahl der Reaktionen - 24/96 Präparate
Menge des Ausgangsmaterials - 100 ng~1 μg Gesamt-RNA
Ziel - Entfernung von rRNA und 45S ITS/ETS aus menschlicher Gesamt-RNA
Abbildungen
spezifität der rRNA-Entfernung
Bei herkömmlichen Proben können rRNA und ITS/EST zu mehr als 98 % entfernt werden, während bei FFPE-Proben mit einer Integrität von etwa 50 % rRNA und ITS/EST zu mehr als 95 % entfernt werden können. Gleichzeitig können auch FFPE-Proben mit schlechter Integrität wirksam entfernt werden.
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