Das SMART-Seq HT Kern-Kit (SS-HT) und das SMART-Seq HT PLUS Kit (SS-HT PLUS) sind automatisierungsfreundliche Kits, die Oligo(dT)-Priming verwenden, um hochwertige cDNA in voller Länge direkt aus 1-100 Zellen oder 10 pg-1 ng Gesamt-RNA zu erzeugen. Zusätzlich zum Kern-Kit für die cDNA-Synthese enthält das SS-HT PLUS-Kit auch ein Kit für die Bibliotheksvorbereitung und Einweg-Unique-Dual-Index-Platten (UDI) für die Generierung von Illumina-kompatiblen Sequenzierungsbibliotheken, was es zu einer kompletten End-to-End-Lösung macht.
Das SS-HT cDNA-Synthese-Kit verfügt über ein gestrafftes Protokoll, das für die Arbeit nach dem FACS optimiert ist, und reduziert den Zeitaufwand im Vergleich zu den SMART-Seq v4-Kits durch die Einführung eines praktischen kombinierten Schritts für die reverse Transkription und PCR-Amplifikation. Die zentrale SMART-Technologie (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template), die die cDNA-Synthese antreibt, bietet eine vollständige Transkriptabdeckung und ist damit ein leistungsstarkes Werkzeug für die Untersuchung der Genexpression in einzelnen Zellen, einschließlich Spleißverbindungen und alternativem Spleißen. Oligo(dT)-Priming wird zur spezifischen Amplifikation von mRNA entweder aus hochwertiger Gesamt-RNA (RIN >8) oder aus intakten Zellen verwendet. Die LNA-Technologie verbessert die Effizienz des Template-Switchings, wodurch sich die Zahl der identifizierten Gene im Vergleich zu anderen Methoden erhöht.
Das SS-HT PLUS Kit beinhaltet unsere patentierte Chemie zur Bibliotheksvorbereitung, die enzymatische Fragmentierung und Stem-Loop-Adapter verwendet, um hochwertige, Illumina-kompatible Bibliotheken aus der mit dem Core Kit synthetisierten cDNA zu erstellen. Dieser zweistufige Arbeitsablauf findet in einem einzigen Röhrchen statt und kann in etwa zwei Stunden abgeschlossen werden - es sind keine Zwischenreinigungsschritte erforderlich.
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