Die NextGENe-Software ist der perfekte analytische Partner für die Analyse von Desktop-Sequenzierungsdaten, die von Illumina® iSeq-, Miniseq-, MiSeq-, NextSeq-, HiSeq- und NovaSeq-Systemen, Ion Torrent Ion GeneStudio S5-, PGM- und Proton-Systemen sowie anderen Plattformen erzeugt werden.
Die NextGENe-Software läuft auf einem Windows®-Betriebssystem, das eine biologenfreundliche "Point & Click"-Benutzeroberfläche bietet. Sie erfordert keine Skripterstellung oder andere bioinformatische Unterstützung, die bei der Verwendung von Programmen wie CLC Genomics Workbench, Lasergene's SeqMan Pro sowie akademischer Software wie MAQ & SOAP, Top Hat, BWA & Bowtie oft erforderlich sind.
Die NextGENe-Software nutzt einzigartige plattformspezifische Technologien in einem eigenständigen Multiapplikationspaket. Die NextGENe-Software enthält Analysemodule für:
SNP/Indel-Erkennung
Keimbahn
Somatische
Exom-Erfassung, Whole Exome Sequencing (WES)
Vollständige Genomsequenzierung (WGS)
Strukturelle Varianzanalyse (einschließlich Nachweis von Fusionsgenen)
Familienbasierte und Trio-Vergleiche
Tumor-Normal-Vergleiche
Nachweis von Kopienzahlvariationen (CNV) und Alternative zum MLPA-ähnlichen Screening
de novo-Zusammensetzung
Transkriptom; Analyse des alternativen Spleißens und der Transkript-Expressionsniveaus
ChIP-Seq, digitale Genexpression (DGE), miRNA-Analyse & Quantifizierung & Metagenomik
Die NextGENe-Software wurde in einer biologenfreundlichen Windows®-Umgebung entwickelt, die den Bedarf an zusätzlichen Bioinformatik-Ressourcen und -Kosten erheblich reduziert. NextGENe Software nutzt kostengünstige 64-bit Windows OS basierte Hardware. (Klicken Sie hier für die vorgeschlagene Hardwarekonfiguration)
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