Reagenzkit / als Lösung AccuraCode®

NGSfür Medikamente

AccuraCode® ist ein Hochdurchsatz-RNA-Bibliotheks-Kit, das sich perfekt für das Wirkstoff-Screening oder andere groß angelegte Screening-Zwecke eignet. Es kann die mRNA erfassen und die RNA-Bibliotheken aus Hunderten von medikamentenbehandelten Zellkulturen in nur wenigen Stunden aufbauen. Der AccuraCode® ermöglicht die gleichzeitige Erstellung einer gepoolten Sequenzierbibliothek aus 96 oder 384 Zellkulturen. Das Wirkstoffscreening und der anschließende Evaluierungsprozess können mit dem AccuraCode® Kit erheblich beschleunigt werden, da die gewonnenen Informationen über die Reaktion auf den Wirkstoff multidimensional sind. Die AccuraCode®-Technologie für das Wirkstoffscreening kann nicht nur die spezifischen Stoffwechselwege identifizieren, die durch den Wirkstoff beeinflusst werden, sondern auch die zellulären Transkriptionsveränderungen aufzeigen, die durch die Behandlung mit dem Wirkstoff ausgelöst werden. Die gewonnenen multidimensionalen Informationen ermöglichen somit eine umfassende Bewertung des Wirkmechanismus eines getesteten Arzneimittels. Das AccuraCode®-Kit kombiniert die Barcodierung von Proben (unter Verwendung von Well Barcodes) mit einer einstufigen Amplifikationsreaktion zur reversen Transkription (OneStep RT-PCR), um effizient cDNA-Moleküle aus jeder einzelnen Zellkultur auf einer Well-Platte zu gewinnen. Die synthetisierte cDNA aus mehreren Zellkulturen wird dann gepoolt und für den Aufbau einer NGS-Bibliothek verwendet. Nach der Sequenzierung werden die Transkripte anhand der Well-Barcode-Informationen den entsprechenden Wells zugeordnet und können mit der AccuraCode-Analysepipeline einfach analysiert werden. Um die Konsistenz der Leistung des AccuraCode®-Kits über mehrere Replikate hinweg zu überprüfen, wurde die A549-Krebszelllinie mit 20uM eines Medikaments P behandelt. Die Genexpression wurde in sechs Zellkulturen untersucht, die der gleichen Behandlung unterzogen wurden.