Mit der GEXSCOPE®-Technologie von Singleron werden einzelne Zellen in einzelne Mikrovertiefungen aufgeteilt und die mRNAs durch eindeutig barcodierte Beads eingefangen. Die mRNA wird dann in cDNA revers transkribiert, gefolgt von einem Zirkularisierungsschritt, der durch einen Kreisgriff eingeleitet wird. Durch die Zirkularisierung der cDNA wurde die V(D)J-Region näher an den Sequenzierprimer herangeführt. Nach zwei Anreicherungsrunden werden die Produkte fragmentiert und zu einer Volllängen-VDJ-Bibliothek für die Illumina-Kurzstreckensequenzierung zusammengestellt.
Hohe RNA-Capture-Effizienz und V(D)J-Spezifität
VDJ-Rekombination ist der Prozess, bei dem T-Zellen und B-Zellen nach dem Zufallsprinzip verschiedene Gensegmente - die so genannten variablen (V), Diversitäts- (D) und Verbindungsgene (J) - zusammenfügen, um einzigartige Rezeptoren (so genannte Antigenrezeptoren) zu erzeugen, die gemeinsam viele verschiedene Molekültypen erkennen können. Die V(D)J-Region ist eine der am stärksten diversifizierten Regionen im menschlichen Genom und trägt zu den komplexen menschlichen Immunreaktionen bei. Die Kenntnis der vollständigen Sequenzen der V(D)J-Regionen von T- und B-Zellen ermöglicht daher ein genaueres Verständnis der Immunprozesse.
Höhepunkte:
- Umfassend - kombiniert Transkriptom-Profiling mit TCR- oder BCR-Sequenzen in voller Länge
- Hoher Durchsatz - gleichzeitige Verarbeitung von bis zu 10.000 Zellen in einem einzigen Durchgang
- Hohe Mapping-Rate - erhöhen Sie den Anteil der Zellen mit V(D)J-Sequenzen in voller Länge
- Hohe Capture-Effizienz - nutzen Sie die Vorteile des robusten PolyA-Capture
Anwendungen
01
Immune Mikroumgebung
In den Tumor eindringende T- und B-Zellen
02
Autoimmunkrankheiten
Identifizierung abnormaler T- und B-Zellen im Immunsystem
03
Transplantation
Erkennen von Abstoßungsrisiken bei Transplantationen
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