Die Software verfügt über integrierte Datenanalysemodule mit automatischer Baseline-Subtraktion und Schwellenwertberechnung zur Bestimmung von Ct-Werten oder möglichen Standardkurven und PCR-Effizienzen.
Weitere Analysenis können ebenfalls automatisch durchgeführt werden, wie absolute oder relative Quantifizierung.
Die Software umfasst auch Analysemethoden zur sondenbasierten Alleldiskriminierung und die Verwendung einer Positiv-/Negativanalyse über die Endpunktdetektion von Proben.