Auf Reverse Complement (RC-PCR) basierende MPS-Bibliotheksvorbereitungslösung für die Analyse hypervariabler Regionen (Mutations-Hotspots) in sehr geringen Mengen (stark degradierter) nuklearer mtDNA in komplexen Proben, die keine vollständige STR liefern. Für Labore in Ländern, in denen die vollständige Genomsequenzierung in der Forensik durch Richtlinien oder Vorschriften eingeschränkt ist.
RC-PCR ermöglicht die gezielte Multiplex-Amplifikation, die Sequenzierungsindexierung und die Zugabe von Adaptern, die gleichzeitig in einer einzigen Reaktion in einem geschlossenen Röhrchen stattfinden.
Kompatibilität
Alle Amplikons sind so konzipiert, dass sie die kürzest möglichen Fragmentlängen aufweisen und mit illumina® MiSeq™-Systemen kompatibel sind, mit 2x 10 bp Unique Dual Index reads.
Die IDseek® Kits wurden mit Gerbsäure und Huminsäure getestet. Die RC-PCR-Technologie ermöglicht die zuverlässige Analyse von stark degradierten Proben, die häufig in der forensischen Fallarbeit vorkommen.
Sequenzfertige Bibliotheken
IDseek® umfasst eine Komplettlösung von Reagenzien und Verbrauchsmaterialien, die für die Erstellung sequenzfertiger MPS-Bibliotheken für forensische Anwendungen erforderlich sind: von der Indexierung über die Amplifikation bis hin zur magnetischen Bibliotheksreinigung und Größenauswahl.
IDseek®-Komponenten
IDseek® Reagenzien und Verbrauchsmaterialien, die für 96 Reaktionen benötigt werden:
- RC-PCR Sonden-Mix
- RC-PCR HiFi 2x Hotstart PCR Mastermix
- 2x Dehydrierte vorgetupfte Unique Index Primer-Platten
- AmpliClean™ Reinigung, magnetische Perlen
Zur Verwendung mit dem AmpliClean™ Magnetic Bead Cleanup wird ein Magnet empfohlen, der mit 1,5 mL/2,0 mL Zentrifugenröhrchen kompatibel ist.
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