β-Synuclein ist ein Mitglied der Synuclein-Proteinfamilie, die anderen beiden Mitglieder sind α- und γ-Synuclein, wobei jedes Protein von einem anderen, aber verwandten Gen kodiert wird. α-Synuclein wurde ursprünglich als ein wichtiges synaptisches Vesikel-assoziiertes Protein aus dem elektrischen Organ des Fisches Torpedo isoliert, und direkte Homologe von α-Synuclein finden sich in allen Wirbeltieren. Spätere Arbeiten brachten die Expression von α-Synuclein mit mehreren menschlichen Gehirnpathologien in Verbindung, so dass es ein Hauptbestandteil der Lewy-Körperchen der Parkinson-Krankheit ist. β-Synuclein wurde als Bestandteil des normalen und kranken menschlichen Gehirns als ein Protein isoliert, das eindeutig mit α-Synuclein verwandt ist, sich aber von diesem unterscheidet. Das menschliche β-Synuclein-Molekül hat eine Größe von 134 Aminosäuren im Vergleich zu 140 Aminosäuren für α-Synuclein, und die N-terminalen Hälften der beiden Moleküle sind praktisch identisch, während die C-terminalen Regionen variabler sind.
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