Aldolase A wird im Allgemeinen als Muskelenzym betrachtet. Nördliche Analysen von kultivierten Zellen deuten darauf hin, dass sie sowohl in Neuronen als auch in Glia vorkommt. Die Aldolase C ist zu 81 % mit der Aldolase A und zu 70 % mit der Aldolase B aminosäureidentisch.
Frühere Studien, bei denen isozymspezifische Antikörper verwendet wurden, haben ergeben, dass sie in Astrozyten der grauen Substanz und in Zellen der Pia mater vorkommt. Die In-situ-Hybridisierung des Zentralnervensystems der Maus unter Verwendung isozymspezifischer Sonden ergab, dass Aldolase A und C in komplementären Zelltypen exprimiert werden: Die mRNA der Aldolase A findet sich in Neuronen; die Botschaft der Aldolase C wird in Astrozyten, einigen Zellen der Pia mater und Purkinje-Zellen nachgewiesen. Aldolase C kann in manchen Situationen als Astrozytenmarker verwendet werden. Die Purkinje-Zellen des Kleinhirns enthalten jedoch hohe Mengen des Enzyms, so dass das Enzym nicht vollständig astrozytenspezifisch ist.
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