IGTR Panel v1.0 deckt die gesamten Immunoglobulin (IG)- und T-Zell-Rezeptor (TR)-kodierenden Gensegmente des menschlichen Genoms ab, die für die Anreicherung von Segmenten vor oder nach einer Umlagerung durch V(D)JC-Rekombination auf DNA-Ebene und die Anreicherung von reifem Transkript auf RNA-Ebene verwendet werden können.
Können RNA-Proben direkt für die Bibliotheksvorbereitung mit diesem Kit verwendet werden?
Nein. Dieses Kit ist nur mit gDNA oder cDNA als Ausgangsproben kompatibel. Für RNA-Proben ist eine reverse Transkription zur Erzeugung von cDNA vor der Bibliothekspräparation erforderlich.
Was ist der empfohlene Eingabebereich? Wie behandelt man Inputs, die diesen Bereich überschreiten?
Dieses Kit unterstützt 50-2.000 ng gDNA oder cDNA. Wenn die Eingangsmenge 2.000 ng überschreitet, teilen Sie die Probe in mehrere Reaktionen auf, um die Amplifikationseffizienz zu erhalten.
Wie groß ist die Insertgröße dieses Kits? Wie wähle ich die Sequenzierlänge aus?
Der Hauptpeak der PCR-Produkte bei Verwendung dieses Kits beträgt ~270 bp. Die PE150-Sequenzierung wird für eine hochwertige Abdeckung empfohlen.
Welches ist das empfohlene Sequenzierdatenvolumen für die Analyse des IGTR-Immunrepertoires?
Ein Minimum von 0,3 Gb wird empfohlen, um Klone mit einer Abundanz von 0,01 % bei einem Input von 200 ng zu erkennen. Erhöhen Sie das Datenvolumen, um die Empfindlichkeit für Klone mit geringer Häufigkeit zu verbessern.
Ist dieses Kit für die Überwachung der minimalen Resterkrankung (MRD) geeignet?
Ja. Dieses Kit enthält einen IG-Primer-Mix und einen TR-Primer-Mix mit genspezifischen Primern in separaten Röhrchen, die eine flexible Kombination in einer einzigen Amplifikationsreaktion ermöglichen. Mit seiner hohen Sensitivität erfüllt das Kit die Anforderungen für die Entwicklung von MRD-Überwachungstechnologien und für klinische Anwendungen und ist somit ideal für den Nachweis von Varianten mit geringer Häufigkeit.
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