HiSNP Ultra Panel v1.0 wurde für die hochauflösende Analyse des Status der Genomzusammensetzung entwickelt. Dieses auf einem SNP-Skelett basierende Panel kann das gesamte Genom in einem Abstand von 50 Kb scannen, indem es auf über 52.000 SNP-Stellen mit hohem MAF abzielt.
HiSNP Panel v1.0 ist für die Analyse des Status der genomischen Zusammensetzung mit einfacher Auflösung konzipiert. Mit diesem auf einem SNP-Skelett basierenden Panel kann das gesamte Genom in einem Abstand von 300 Kb gescannt werden, wobei über 9.000 SNP-Stellen mit hohem MAF erfasst werden.
Merkmal
Hohes Heterozygotie-Verhältnis: Umfassendes Design für Europäer, Afrikaner, Amerikaner und Asiaten (AF=0,05-0,95)
Stabile Capture-Leistung: GC ausgeglichen; einzigartige flankierende Sequenz (durch WGS verifiziert)
Angemessene Proportionalität: Gleichmäßige Verteilung im gesamten Genom; LD-Stellen ausgeschlossen
Hervorragende Kompatibilität: Verwendung allein oder als Spike in anderen CDS-Panels
Können RNA-Proben direkt für die Bibliotheksvorbereitung mit diesem Kit verwendet werden?
Nein. Dieses Kit ist nur mit gDNA oder cDNA als Ausgangsproben kompatibel. Für RNA-Proben ist eine reverse Transkription zur Erzeugung von cDNA vor der Bibliotheksvorbereitung erforderlich.
Was ist der empfohlene Eingabebereich? Wie behandelt man Inputs, die diesen Bereich überschreiten?
Dieses Kit unterstützt 50-2.000 ng gDNA oder cDNA. Wenn die Eingangsmenge 2.000 ng überschreitet, teilen Sie die Probe in mehrere Reaktionen auf, um die Amplifikationseffizienz zu erhalten.
Wie groß ist die Insertgröße dieses Kits? Wie wähle ich die Sequenzierlänge aus?
Der Hauptpeak der PCR-Produkte bei Verwendung dieses Kits beträgt ~270 bp. Die PE150-Sequenzierung wird für eine hochwertige Abdeckung empfohlen.
Welches ist das empfohlene Sequenzierdatenvolumen für die Analyse des IGTR-Immunrepertoires?
Ein Minimum von 0,3 Gb wird empfohlen, um Klone mit einer Abundanz von 0,01 % bei einem Input von 200 ng zu erkennen.
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