Reagenzkit / als Lösung OncoFu Elite v1.0

für ForschungszweckeARN-Analysefür Analyse

OncoFu Elite (für RNA) Panel v1.0 zielt auf 105 Gene ab, die in Studien zu soliden Tumoren am häufigsten vorkommen oder für klinisch bedeutsame Fusionen relevant sind. Die Sonden decken alle kodierenden Transkriptregionen und einige UTR-Regionen ab, die am Auftreten von Fusionen beteiligt sind und offiziell in RefSeq 109 enthalten sind. Das Panel unterstützt die Anreicherung von Fusions-, Mutations- und Genexpressionsinformationen auf der RNA-Ebene. Können RNA-Proben direkt für die Bibliotheksvorbereitung mit diesem Kit verwendet werden? Nein. Dieses Kit ist nur mit gDNA oder cDNA als Ausgangsproben kompatibel. Für RNA-Proben ist eine reverse Transkription zur Erzeugung von cDNA vor der Bibliotheksvorbereitung erforderlich. Was ist der empfohlene Eingabebereich? Wie behandelt man Inputs, die diesen Bereich überschreiten? Dieses Kit unterstützt 50-2.000 ng gDNA oder cDNA. Wenn die Eingangsmenge 2.000 ng überschreitet, teilen Sie die Probe in mehrere Reaktionen auf, um die Amplifikationseffizienz zu erhalten. Wie groß ist die Insertgröße dieses Kits? Wie wähle ich die Sequenzierlänge aus? Der Hauptpeak der PCR-Produkte bei Verwendung dieses Kits beträgt ~270 bp. Die PE150-Sequenzierung wird für eine hochwertige Abdeckung empfohlen. Welches ist das empfohlene Sequenzierdatenvolumen für die Analyse des IGTR-Immunrepertoires? Ein Minimum von 0,3 Gb wird empfohlen, um Klone mit einer Abundanz von 0,01 % bei einem Input von 200 ng zu erkennen. Erhöhen Sie das Datenvolumen, um die Empfindlichkeit für Klone mit geringer Häufigkeit zu verbessern. Ist dieses Kit für die Überwachung der minimalen Resterkrankung (MRD) geeignet? Ja. Dieses Kit enthält einen IG-Primer-Mix und einen TR-Primer-Mix mit genspezifischen Primern in separaten Röhrchen, die eine flexible Kombination in einer einzigen Amplifikationsreaktion ermöglichen.