Reagenzkit / als Lösung NanOnco Plus Panel v3.0

für ForschungszweckeDiagnosefür HLA-B-Gen

Das NanOnco Plus Panel v3.0 zielt auf die vollständigen kodierenden Regionen von 620 Genen (einschließlich HLA-Genen) ab, die für Studien zu soliden Tumoren von Interesse sind, sowie auf eine Reihe von Intron-Regionen, die mit häufigen Fusionen, klassischen Mikrosatelliten-Sequenzen und chemotherapie-assoziierten polymorphen Loci zusammenhängen. Dieses Panel umfasst insgesamt 637 Gene, die eine Zielregion von ca. 2,4 Mb des Genoms abdecken. Es unterstützt die Anreicherung mehrerer Varianten, einschließlich Basensubstitution, Insertion/Deletion, Genumlagerung, Genamplifikation, Mikrosatelliteninstabilität usw. Können RNA-Proben direkt für die Bibliotheksvorbereitung mit diesem Kit verwendet werden? Nein. Dieses Kit ist nur mit gDNA oder cDNA als Ausgangsproben kompatibel. Für RNA-Proben ist eine reverse Transkription zur Erzeugung von cDNA vor der Bibliothekspräparation erforderlich. Was ist der empfohlene Eingabebereich? Wie behandelt man Inputs, die diesen Bereich überschreiten? Dieses Kit unterstützt 50-2.000 ng gDNA oder cDNA. Wenn die Eingangsmenge 2.000 ng überschreitet, teilen Sie die Probe in mehrere Reaktionen auf, um die Amplifikationseffizienz zu erhalten. Wie groß ist die Insertgröße dieses Kits? Wie wähle ich die Sequenzierlänge aus? Der Hauptpeak der PCR-Produkte bei Verwendung dieses Kits beträgt ~270 bp. Die PE150-Sequenzierung wird für eine hochwertige Abdeckung empfohlen. Welches ist das empfohlene Sequenzierdatenvolumen für die Analyse des IGTR-Immunrepertoires? Ein Minimum von 0,3 Gb wird empfohlen, um Klone mit einer Abundanz von 0,01 % bei einem Input von 200 ng zu erkennen. Erhöhen Sie das Datenvolumen, um die Empfindlichkeit für Klone mit geringer Häufigkeit zu verbessern.