Reagenz / als Lösung NEXome

Auf der Grundlage der neuesten Version von Refseq (109, 2021) und der CCDS-Datenbank hat das NEXome Core Panel sorgfältig einige Regionen ausgewählt, die es wert sind, außerhalb der Datenbank berücksichtigt zu werden. Gleichzeitig wurden aus Gründen der Produktkontinuität einige Regionen, die in der letzten Version der Datenbank gelöscht wurden, beibehalten. Das NEXome Core Panel enthält ca. 400.000 einzelsträngige DNA-Sonden, die unabhängig synthetisiert und unabhängig auf ihre Qualität geprüft wurden und auf eine 34,7 MB große genomische Region (19.613 Gene) abzielen. Das NEXome Core Panel ist ein zentrales All-Exome-Panel, das mit verschiedenen Spike-in-Panels kombiniert werden kann, um unterschiedliche Anwendungsanforderungen zu erfüllen. Produktion und Qualitätskontrolle Unabhängig synthetisiert und unabhängig auf Qualität geprüft Können RNA-Proben mit diesem Kit direkt für die Bibliotheksvorbereitung verwendet werden? Nein. Dieses Kit ist nur mit gDNA oder cDNA als Ausgangsproben kompatibel. Für RNA-Proben ist vor der Bibliotheksvorbereitung eine reverse Transkription zur Erzeugung von cDNA erforderlich. Was ist der empfohlene Eingabebereich? Wie behandelt man Inputs, die diesen Bereich überschreiten? Dieses Kit unterstützt 50-2.000 ng gDNA oder cDNA. Wenn die Eingangsmenge 2.000 ng überschreitet, teilen Sie die Probe in mehrere Reaktionen auf, um die Amplifikationseffizienz zu erhalten. Wie groß ist die Insertgröße dieses Kits? Wie wähle ich die Sequenzierlänge aus? Der Hauptpeak der PCR-Produkte bei Verwendung dieses Kits beträgt ~270 bp. Die PE150-Sequenzierung wird für eine hochwertige Abdeckung empfohlen. Welches ist das empfohlene Sequenzierdatenvolumen für die Analyse des IGTR-Immunrepertoires? Ein Minimum von 0,3 Gb wird empfohlen, um Klone mit einer Abundanz von 0,01 % bei einem Input von 200 ng zu erkennen. Erhöhen Sie das Datenvolumen, um die Empfindlichkeit für Klone mit geringer Häufigkeit zu verbessern.