Software zur NGS-Sequenzierung Mix²

LaborAnalyse

Präzise Schätzungen der Transkriptkonzentration Genaue Erkennung von unterschiedlicher Expression Außergewöhnliche Reproduzierbarkeit unter variablen Bedingungen Schnelle Laufzeiten und geringer Speicherbedarf Mix² Software zur RNA-Seq-Datenanalyse Ein Software-Tool für die genaue Schätzung der RNA-Konzentration aus RNA-Seq-Daten. Modell Der Fragment-Bias bei RNA-Seq stellt eine ernsthafte Herausforderung für die genaue Quantifizierung von Gen-Isoformen dar. Mix² macht keine Annahmen über den Coverage Bias, sondern passt für jede Gen-Isoform ein Mischungsmodell an die Daten an (Abb. 1). Mix² kann daher z. B. den 5'-Bias genau darstellen, wie in Abb. 1 (a und b) gezeigt, während Cufflinks auf eine gleichmäßige Verteilung beschränkt ist (Abb. 1c). Ein Software-Tool für die genaue Schätzung der RNA-Konzentration aus RNA-Seq-Daten.