Reagenzkit / als Lösung QuantSeq

für ProbenNGSNukleinsäure

Kosteneffiziente genomweite Analyse der Genexpression Einsparung von Sequenzierungstiefe durch Erzeugung von nur einem Fragment pro Transkript Schnelles und einfaches All-in-One-Protokoll: weniger als 4,5 Stunden Geeignet für geringen Input (1 ng Gesamt-RNA) und FFPE-Proben Kostenlose Datenanalyse-Pipeline für Nicht-Bioinformatiker UMIs zur Erkennung von PCR-Duplikaten verfügbar NEU! Pakete mit bis zu 384 Unique Dual Indices (UDIs) Das QuantSeq FWD-Kit ist ein Bibliotheksvorbereitungsprotokoll, das für die Generierung Illumina-kompatibler Bibliotheken von Sequenzen nahe dem 3'-Ende polyadenylierter RNA entwickelt wurde. QuantSeq FWD enthält die Illumina Read 1-Linkersequenz im Primer für die Zweitstrangsynthese, so dass NGS-Reads in Richtung des Poly(A)-Schwanzes generiert werden, die direkt die mRNA-Sequenz widerspiegeln (siehe Workflow). Diese Version ist der empfohlene Standard für die Genexpressionsanalyse. Lexogen bietet darüber hinaus eine Hochdurchsatzversion mit optionaler dualer Indizierung (i5- und i7-Indizes) an, mit der bis zu 9.216 Proben in einer Lane gemultiplext werden können. Mapping von Transkript-Endstellen Durch die Verwendung längerer Reads ermöglicht QuantSeq FWD die exakte Lokalisierung des 3'-Endes von poly(A)-RNA (siehe Abb. 3) und damit den Erhalt genauer Informationen über die 3'-UTR. Analyse von Proben mit geringem Input und geringer Qualität Die empfohlene Inputmenge an Gesamt-RNA liegt bei nur 1 ng. QuantSeq eignet sich für die reproduzierbare Generierung von Bibliotheken aus RNA geringer Qualität, einschließlich FFPE-Proben. Siehe Abb. 1 und 2 für einen Vergleich von zwei verschiedenen RNA-Qualitäten (FFPE und frisch gefrorener Kryoblock) derselben Probe.