Reagenzkit / als Lösung

NGSzur Herstellung von RNA-Bibliotheken

mRNA-Seq einschließlich Poly(A)-Selektion Breites Spektrum an Gesamt-RNA-Input (1 ng bis 1 μg) Einfacher All-in-One-Arbeitsablauf Von der Poly(A)-Selektion bis zur sequenzierfertigen Bibliothek in 5,5 Stunden Einzigartige molekulare Identifikatoren (UMIs) enthalten einschließlich 12 nt Unique Dual Indices (UDIs) Das CORALL mRNA-Seq Library Prep Kit ermöglicht die schnelle und kosteneffiziente Generierung von gestrandeten, UMI-markierten und einzigartigen dual indizierten Bibliotheken für Ganztranskriptom-Poly(A)-RNA-Analysen mit Illumina® NGS-Plattformen. Überlegene End-to-End-Abdeckung Die umfassende Abdeckung von CORALL liefert eine verbesserte Darstellung der Transkript-Start- und Endstellen. Die Read-Abdeckung wurde unter Verwendung der ERCC-Spike-in-Kontrollen analysiert, die präzise, bekannte Transkriptionsstart- und -endstellen (TSS bzw. TES) aufweisen. CORALL-Reads lassen sich genauer auf die exakten ERCC-TSS abbilden (Abb. 3A) als die Bibliotheken der Mitbewerber, die die echten Startstellen nicht abdecken. Darüber hinaus bietet CORALL eine erhöhte Abdeckung an der TES (Abb. 3B). Datenanalyse Eine Datenanalyse-Pipeline ist jetzt auf der BlueBee® Genomics Plattform verfügbar. Mit dieser Pipeline können die Benutzer des Kits die Lesequalitätskontrolle, das Mapping, die Deduplizierung des Unique Molecular Identifier (UMI) und die Quantifizierung von Transkripten durchführen. Um Ihren Aktivierungscode zu verwenden, müssen Sie sich bei BlueBee registrieren (https://lexogen.bluebee.com/portal) und Ihre Daten (fastq.gz-Dateien) hochladen. HINWEIS: BlueBee Data Analysis ist für eine Reihe von Arten verfügbar, siehe FAQ 7. Referenzgenome für neue Arten können auf Anfrage hinzugefügt werden. Bitte beachten Sie, dass dies mit einer Gebühr verbunden ist. Weitere Einzelheiten finden Sie unter CORALL-Datenanalyse.