Analysieren Sie die transkriptomweite Kinetik der RNA-Synthese und des RNA-Umsatzes
Messung der Expression naszierender RNA und der Transkriptstabilität
Verbessern der zeitlichen Auflösung der differentiellen Expression
Identifizierung von primären und sekundären Transkriptionszielen
Kein Pull-down oder biochemische Isolierung erforderlich
Verwendung in Kombination mit QuantSeq 3' mRNA-Seq für kosteneffektive,
metabolische Sequenzierung mit hohem Durchsatz
SLAMdunk - automatisierte und benutzerfreundliche SLAMseq-QuantSeq-Datenanalyse
pipeline auf der BlueBee ® Genomik-Analyseplattform
SLAMseq ist eine hochempfindliche Methode zur zeitaufgelösten Messung von neu synthetisierter und vorhandener RNA in kultivierten Zellen. SLAMseq ermöglicht die Auflösung der Kinetik von RNA-Synthese und -Degradation.
Lexogen bietet eine Familie von Kits an, die auf der neuen SLAMseq-Methode basieren: Thiol (SH)-verknüpfte Alkylierung für die metabolische Sequenzierung von RNA. SLAMseq ermöglicht die parallele Identifizierung und Quantifizierung von neu synthetisierter (naszierender) und bereits vorhandener RNA aus derselben Probe, ohne dass eine biochemische Isolierung erforderlich ist. SLAMseq kann problemlos auf Experimente mit lebenden Zellen angewendet werden. In Kombination mit der QuantSeq 3'-mRNA-Seq-Bibliotheksvorbereitung bietet SLAMseq eine vollständige, benutzerfreundliche Hochdurchsatzlösung für die Analyse der transkriptomweiten RNA-Synthese und Umsatzkinetik.
Das SLAMseq-Kit-Portfolio umfasst Explorer- und Kinetik-Module, die das gesamte metabolische RNA-Markierungsexperiment abdecken, von der Optimierung der Markierungsbedingungen über die Markierung naszierender oder vorhandener RNA bis hin zur Alkylierung für die nachgeschaltete NGS-Bibliotheksvorbereitung.
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