Unser DepleteX High Expressing RNA Depletion Kit entfernt die am stärksten exprimierenden Transkripte in-vitro vor der Sequenzierung und verteilt ~70%* der Sequenzierungs-Reads auf einzigartige, biologisch relevante Transkripte - so können Sie die Erkennung von niedrig exprimierenden Transkripten oder seltenen Isoformen maximieren.
Erhöhte Nachweisempfindlichkeit in Fibroblasten und Vollblut
Die Resequenzierung hoch exprimierender Transkripte liefert nur wenige biologisch relevante Informationen. Leider verdrängen diese Transkripte niedrig exprimierende Transkripte bei der Sequenzierungsabdeckung. Diese mangelnde Abdeckung in Verbindung mit dem erheblichen Rauschen hoch exprimierender Transkripte schränkt die Erkennung von niedrig exprimierenden Genen, seltenen Varianten und einzigartigen Fusionsereignissen ein, die möglicherweise krankheitsauslösend sind.
DepleteX nutzt Cas9 und ein Guide-RNA-Set, das entwickelt wurde, um 70 % der am höchsten exprimierenden Transkripte aus poly-A-selektierten RNA-Seq-Bibliotheken zu entfernen, die aus Fibroblasten und Vollblut stammen. Dieses Guide Set wurde entwickelt, um die Neuzuordnung der gesamten Sequenzierungs-Reads zu maximieren und die Sequenzierungsabdeckung von seltenen, niedrig exprimierenden Transkripten und einzigartigen Fusionsereignissen zu erhöhen.
Höhepunkte
Deplete >4.000 hochexprimierte Transkripte in Vollblut und Fibroblasten
Zuweisung von ~70%* mehr Reads zu biologisch relevanten Transkripten mit geringer Expression
Maximierung der Varianten- und Isoform-Erkennung mit weniger Sequenzierung
Erhöhte Erkennung von Transkripten mit niedriger Expression
Einfache Integration in Ihren Arbeitsablauf durch ein einfaches und flexibles Protokoll
Über
Das Kit enthält Leit-RNA und Abreicherungsreagenzien für die Abreicherung nach der Bibliothek.
Spezifikation
Proben pro Kit - 24
Untersuchte Gewebe im Design - Fibroblasten, Vollblut
Depletionsgehalt - ~4.450 hoch exprimierende Transkripte
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