Software-Modul / zur NGS-Sequenzierung SEQHLA

LaborAnalyse

SEQHLA ist eine leistungsstarke und benutzerfreundliche Anwendung für die Analyse von HLA-Sequenz-basierten Typisierungsdaten von allen Sanger-Sequenzierungsplattformen. Alle IMGT HLA-Datenbankversionen sind zum Herunterladen und Importieren verfügbar. Es verwendet einen einzigartigen lernenden Basen-Caller, der auf Peakflächen-Statistikdaten basiert und über eine eigene Auto-Edit-Funktion verfügt. Konstante Positionen können auf Wunsch für die Analyse ignoriert werden. Das Ergebnis kann in maximaler, 1-Feld- oder 2-Feld-Auflösung und als NMPD-Code angezeigt werden. Alle Ergebnisdaten können an laborinterne LIM-Systeme übertragen und/oder als personalisierte Patientenberichte ausgegeben werden. Kompatibel mit Daten von allen gängigen Sanger-Sequenzierplattformen und Kits Einfache Einrichtung individueller Zielregionen auf der Grundlage der IMGT HLA-Datenbank Konfigurierbarer Base Caller mit sequenzerabhängigen Schwellenwerten Automatisches und benutzerdefiniertes Trimmen von Sequenzierergebnisdateien Anzeige aller Ergebnisse für einen Patienten auf einem Bildschirm, einschließlich der gefundenen Allelkombinationen Automatische Warnung bei Spleißstellenmutationen Möglichkeit, konstante Positionen bei der Analyse zu ignorieren Erkennung von neuen Allelen Anzeige der Ergebnisse in verschiedenen Auflösungen (1-Feld, 2-Feld und max. Auflösung) und als NMDP-Code Peak-Flächen-Statistik: automatischer Vergleich mit allen zuvor analysierten Proben für eine empfindliche Erkennung heterozygoter Positionen auch im Falle eines Allel-Ausfalls Detaillierter HLA-Bericht für einzelne Patienten/Aufträge