Diese in Zusammenarbeit mit Experten für Krebsgenomik entwickelten, vorgefertigten Oligos ermöglichen es Forschern, eine Vielzahl von Genen und Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) zu sequenzieren, die zuvor mit einer Krebsprädisposition in Verbindung gebracht wurden.
Zielt auf 94 Gene und 284 SNPs ab, die mit einer Prädisposition für Krebs in Verbindung gebracht werden
TruSight Cancer umfasst Gene, die sowohl mit häufigen (z. B. Brustkrebs, Darmkrebs) als auch mit seltenen Krebsarten in Verbindung gebracht werden. Darüber hinaus enthält der Satz 284 SNPs, die in genomweiten Assoziationsstudien (GWAS) mit Krebs in Verbindung gebracht wurden. Die Auswahl der Inhalte erfolgte auf der Grundlage der von Experten kuratierten wissenschaftlichen Literatur und anderer hochwertiger Ressourcen.
Das TruSight Cancer Sequenzierpanel bietet kundenspezifische Oligos, die auf die identifizierten Regionen von Interesse abzielen. Es wird ausreichend Produkt für vier Anreicherungsreaktionen geliefert. TruSight Cancer ist mit TruSight Rapid Capture kompatibel.
TruSight Cancer Probendatensätze
mit dem TruSight Cancer Sequenzierpanel wurden 6 humane Referenzproben hergestellt. Diese Bibliotheken wurden auf dem MiniSeq-System mit einem High-Output-Kit bei einer 2 x 100 bp-Leselängenkonfiguration mit doppelter Indizierung sequenziert. Die Gesamtausbeute betrug 5,2 Gb mit 95,8 % der Basen bei oder über Q30.
Spezifikationen
Assay-Zeit - 1,5 Tage
Krebsart - Pan-Krebs
Inhaltliche Spezifikationen - Fester Satz von Sonden, die für 94 Gene und 284 SNPs, die mit häufigen und seltenen Krebsarten assoziiert sind, angereichert sind.
Beschreibung - Keimbahnmutationsnachweisforschung für häufige und seltene Krebsarten.
Praktische Zeit - 5 Stunden
Eingabemenge - 50 ng DNA
Geräte - MiSeq-System, NextSeq 550-System, MiSeqDx im Forschungsmodus, MiniSeq-System, NextSeq 500-System
Methode - Gezielte DNA-Sequenzierung, Target-Anreicherung
Multiplexing - Bis zu 96-Plexe
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