Das AmpliSeq für Illumina Focus Panel ist ein gezielter Resequenzierungs-Assay für die Biomarker-Analyse von 52 Genen mit bekannter Relevanz für solide Tumore. Mit dem Focus Panel können Forscher sowohl DNA als auch RNA gleichzeitig analysieren. Die wichtigsten Merkmale umfassen:
Relevante Geninhalte
Ziel-Biomarker in 52 Genen, die für solide Tumore relevant sind
Schneller, optimierter Arbeitsablauf
Erstellung sequenzierfähiger Bibliotheken an einem einzigen Tag aus nur 1 ng hochwertiger oder 10 ng formalinfixierter, paraffineingebetteter (FFPE) Eingangsproben
Genaue Daten
Erkennen Sie somatische Mutationen bis zu einer Häufigkeit von 5 % mit lokaler oder Cloud-basierter Analyse
Das Focus Panel ist Teil eines integrierten Arbeitsablaufs, der die auf der Polymerase-Kettenreaktion (PCR) basierende Bibliotheksvorbereitung AmpliSeq for Illumina, die Sequenzierung durch Synthese (SBS) von Illumina für die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) und die automatische Analyse umfasst.
Dieses gebrauchsfertige Panel erspart Ihnen die Zeit und den Aufwand für die Identifizierung von Zielen, das Design von Primern und die Optimierung von Panels.
Spezifikationen
Assay-Zeit - 5-6 Stunden (nur Bibliotheksvorbereitung; ohne Quantifizierung der Bibliothek, Normalisierung oder Pooling-Zeit)
Krebsart - Solider Tumor
Beschreibung - Somatische Analyse von 52 Genen, die mit soliden Tumoren in Verbindung stehen.
Praktische Zeit - < 1,5 Stunden
Inputmenge - 1-100 ng (10 ng pro Pool empfohlen)
Anzahl der Amplikons - 553 insgesamt. 2 Pools. (DNA-Pool: 269 Amplikons. RNA-Pool: 284 Amplikons.)
Spezialisierte Probentypen - FFPE-Gewebe
Variantenklasse - Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs), Genfusionen, somatische Varianten, Insertionen/Löschungen (Indels), Kopienzahlvarianten (CNVs)
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