Eine der wichtigsten Überlegungen vor der Durchführung der 2D-Gelelektrophorese ist die Wahl des Puffers für die Proteinsolubilisierung. Ein geeigneter Puffer muss Proteine effektiv solubilisieren, ohne die native Ladung der Proteine zu stören.
Harnstoff, ein gängiges Chaotrop, wird häufig für die Solubilisierung und Denaturierung von Proteinen verwendet. Einer der Nachteile der Verwendung von Harnstoff ist die Carbamylierung. In Wasser befindet sich Harnstoff im Gleichgewicht mit Ammoniumcyanat, dessen Gehalt mit steigender Temperatur und steigendem pH-Wert zunimmt. Cyanat reagiert mit α-Amino- und ε-Aminogruppen von Proteinen und führt zu einer Änderung des isoelektrischen Punkts von Proteinen. Dies führt zu verfälschten Ergebnissen. Daher muss die Carbamylierung vermieden werden
Eine Möglichkeit, das Risiko der Carbamylierung zu minimieren, besteht darin, die harnstoffbasierten Reagenzien vor jeder Verwendung frisch zuzubereiten. G-Biosciences hat eine Reihe von trockenen, harnstoffbasierten, vorgemischten und gebrauchsfertigen Solubilisierungspuffern entwickelt. Geben Sie einfach ein entsprechendes Volumen des mitgelieferten Rehydrationspuffers zu dem trockenen Puffer hinzu. Anschließend werden die Proteine solubilisiert, was Zeit spart und die Qualität der IEF/2D-Gelelektrophorese verbessert (Patent angemeldet).
FOCUS™ Extraktionspuffer können auch als Rehydrationspuffer für IPG-Streifen verwendet werden
FOCUS™ Extraktionspuffer sind experimentell optimierte Konzentrationen von kritischen, puffernden und stabilisierenden Substanzen, einschließlich Harnstoff, Thioharnstoff, Nonidet® P-40, CHAPS und Sulfobetaine. Die FOCUS™-Extraktionspuffer wurden entwickelt, um eine optimale Proteinextraktion und eine verbesserte Spotauflösung für die 2D-Gelanalyse zu erzielen.
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