CleanDTR ist ein effizientes, auf paramagnetischen Beads basierendes System, das von CleanNA entwickelt wurde, um nicht inkorporierte Farbstoffterminatoren aus Sanger-Sequenzierungsreaktionen zu entfernen. Es kann auch für CRISPR-Cas9 verwendet werden. Der CleanDTR-Prozess umfasst drei einfache Schritte: Binden, Waschen und Eluieren. Während das Sequenzierprodukt selektiv an die magnetischen Partikel gebunden wird, werden nicht inkorporierte Farbstoffe, Nukleotide, Salze und Primer durch Waschen mit Ethanol entfernt. Dieses Prinzip ermöglicht die Elution des reinen Sanger-Sequenzierprodukts in den Elutionspuffer Ihrer Wahl. Das Protokoll kann an Ihre aktuelle Liquid-Handling-Workstation (z. B. Beckman, Hamilton, Tecan, Caliper, Perkin Elmer, Agilent und Eppendorf) angepasst werden, wobei Ihr aktuelles Protokoll verwendet wird, und es kann auch manuell durchgeführt werden.
Vorteile
Lange Phred 20-Leselängen von durchschnittlich über 800 bps
Passierraten von über 85 % oder höher
Effiziente Eliminierung von Verunreinigungen der Sequenzierreaktion
Verringerung des BigDye*-Verbrauchs aufgrund einer höheren durchschnittlichen Signalstärke
Anwendungen
Aufreinigung von Sequenzierprodukten für
ABI- und MegaBACE-Plattformen
Unterstützte Chemikalien
- BigDye* Versionen 1.0, 1.1, 2.0, 3.0 und 3.1
- DYEnamic ET
* BigDye ist eine eingetragene Marke von Applied Biosystems
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