Analyse-LIS RiboPrinter®

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Bei der Ribotypisierung handelt es sich um eine fragmentbasierte Technologie, bei der Restriktionsenzyme eingesetzt werden, um Regionen der ribosomalen RNA-Gene (5S, 16S, 23S und die Spacer-Region einschließlich Glu-tRNA) gezielt zu schneiden und so einen DNA-Fingerabdruck zu erzeugen, der für den Organismus auf Stammebene einzigartig ist. Das Ribotyping-System fasst Proben zusammen, deren RiboPrint®-Muster innerhalb eines festgelegten Ähnlichkeitsgrades liegen. Diese Muster können vor oder nacheinander generiert werden und zur Bestimmung des Ähnlichkeitsgrads zwischen Isolaten als Teil einer Nachverfolgung und Trendbestimmung in einem Umweltüberwachungsprogramm (EM) verwendet werden. Unser Team erstellt und pflegt eine benutzerdefinierte Bibliothek für jeden Kunden, der Proben zum Riboprinting einreicht. Jedes Mal, wenn der Kunde eine neue Probe einreichte, wurde diese mit allen früheren Proben in seiner benutzerdefinierten Bibliothek verglichen und einer RiboGroup zugeordnet. In einigen Fällen kann die automatisierte Ribotypisierung weniger effektiv sein als die sequenzbasierte Stammtypisierung, da einige Arten nur eine sehr geringe Diversität innerhalb des vom RiboPrinter® analysierten ribosomalen RNA-Operons aufweisen. In diesen Fällen können sequenzbasierte Methoden zur Charakterisierung von Bakterienstämmen (SLST und MLST) ein wesentlich höheres Maß an Unterscheidungs- und Wiederholbarkeit bieten als die automatisierte Riboprinting-Methode und sollten unbedingt in Betracht gezogen werden. Was ist die Ribotypisierung von Bakterienstämmen? Die Ribotypisierung ist eine automatisierte fragmentbasierte Analyse des DNA-Fingerabdrucks des Organismus unter Verwendung des RiboPrinter®-Systems zur bakteriellen Charakterisierung. Was ist ein Riboprinting-Muster? Riboprinting ist eine fragmentbasierte Technologie, bei der Restriktionsenzyme eingesetzt werden, um gezielt Regionen der ribosomalen RNA-Gene (5S, 16S, 23S,