Die optische Genomkartierung (OGM) erfordert markierte DNA mit ultrahohem Molekulargewicht (UHMW) zur Identifizierung von Strukturvarianten. Bionano bietet eine Reihe von DNA-Probenvorbereitungskits für die einfache und robuste Isolierung von UHMW-DNA aus einer Reihe von wichtigen Probentypen. Sobald die DNA isoliert ist, können unsere Direct Label and Stain (DLS) Kits zur Markierung der DNA für die Verwendung mit dem Saphyr-System verwendet werden.
Erzielen Sie eine robuste Isolierung und Markierung von UHMW-DNA.
Für die Visualisierung großer genomischer Strukturvarianten sind außergewöhnlich große, intakte DNA-Fragmente erforderlich. Die Bionano-Lösungsphase (SP)-Technologie ermöglicht die Isolierung von DNA-Fragmenten, die eine Länge von >1 Mbp erreichen können, und liefert routinemäßig durchschnittliche Fragmente von >230 kbp.
Zum Vergleich: Bei der Short-Read-Sequenzierung werden Leselängen von bis zu 150 bp erzeugt, während die führende hochpräzise Long-Read-Sequenzierung Leselängen von bis zu 25kb liefert.
Isolieren Sie DNA aus einer Reihe von wichtigen Probentypen.
Die neuesten Bionano SP DNA-Prep-Kits sind in der Lage, UHMW-DNA aus Gewebe und Tumoren, Knochenmarkaspiraten (BMA), Blut und Zellen sowie pflanzlichem und tierischem Gewebe zu reinigen. Dank dieser Probenvielfalt eignet sich OGM für ein breites Spektrum von Studien und Anwendungen in der Onkologie, bei konstitutionellen genetischen Erkrankungen, in der Bioprozessierung und in der allgemeinen Forschung.
Die SP-Kits von Bionano benötigen 1,5 * 10^6 Zellen (Blut, Zelllinien und BMA) oder 10 - 30 mg Gewebe als Input. Die UHMW-DNA wird in etwa vier Stunden mit einem Lyse-, Bindungs- und Waschverfahren und neuartigen paramagnetischen Scheiben isoliert.
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