Das PCR-freie NGS DNA Library Prep Kit wurde für den Aufbau von DNA-Bibliotheken für die Sequenzierung der nächsten Generation (Illumina-Plattform) entwickelt. Das Kit fügt effizient 3′-dT-tailed Bibliotheksadapter an beide Enden von DNA-Fragmenten hinzu. Der Kit verwendet doppelsträngige DNA-Fragmente (stumpf und/oder klebrig) als Eingangs-DNA für die Konstruktion von NGS-Bibliotheken und ist mit DNA-Fragmenten kompatibel, die sowohl mit enzymatischen Methoden (BioDynami-DNA-Fragmentierungsenzyme usw.) als auch mit physikalischen Methoden (Sonikation, Vernebelung usw.) erzeugt wurden
Die PCR-Amplifikation ist ein Standardschritt bei der Bibliotheksvorbereitung für das Next-Generation Sequencing. Die PCR wird verwendet, um vollständig ligierte DNA-Fragmente zu amplifizieren und den Bibliotheken Indexinformationen hinzuzufügen. Die Indexierung dient dem Pooling der Bibliotheksproben, um die Kosten für die Sequenzierung zu senken.
Die PCR führt jedoch zu einer ungleichmäßigen Amplifikation der DNA in einigen DNA-Regionen mit extremen GC-Gehalten und Sekundärstrukturen. Diese Verzerrung kann zu einer sehr geringen Sequenzierabdeckung in solchen Regionen führen. Die Sequenzierung von DNA in diesen Regionen ist immer noch eine große Herausforderung.
Eine PCR-freie Bibliotheksvorbereitung kann den Bias der Bibliothek reduzieren und die Sequenzierungslücken minimieren. Die Sequenzierdaten von PCR-freien Bibliotheksproben haben eine gleichmäßige genomische Abdeckung mit wenigen Lücken und einer besseren Tiefe in GC-reichen Regionen. Unser PCR-freies NGS-Kit bietet eine optimale Abdeckung in den Regionen, die traditionell schwierig sind, wie Regionen mit hohem GC-Gehalt, Regionen mit niedrigem GC-Gehalt und Regionen mit repetitiven Sequenzen.
Für das Kit sind zwei Index-Typen erhältlich:
Nicht-Index: Die Bibliotheken haben keinen Index.
Index: Jede Bibliothek enthält einen i5-Index und einen i7-Index. Bibliotheksmultiplexing mit bis zu 96 Proben ist möglich. Die Liste der Indizes kann hier heruntergeladen werden.
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