Der Kit wurde für die Herstellung von qualitativ hochwertigen Bibliotheken für die Next Generation Sequencing (Illumina und MGI Plattformen) entwickelt. Das Kit benötigt doppelsträngige DNA-Fragmente (stumpf und/oder klebrig) als Input-DNA für die NGS-Bibliothekspräparation und ist mit DNA-Fragmenten kompatibel, die sowohl mit enzymatischen Methoden als auch mit physikalischen Methoden (Sonikation, Vernebelung usw.) erzeugt wurden. Bibliotheksmultiplexing ist mit verschiedenen Arten von Indizes möglich.
Das Kit wurde für die Vorbereitung von Next Generation Sequencing (NGS)-Bibliotheken mit verschiedenen Probentypen optimiert. Die meisten DNA-Bibliothekspräparationen erfordern die Ligation von gescherten DNA-Fragmenten an Bibliotheksadaptoren, und die DNA-Bibliothekspräparation ist eng mit der Qualität der NGS-Daten verbunden. Mit den einzigartigen DNA-Bibliotheksvorbereitungstechnologien von BioDynami ermöglicht das schnelle und einfache Kit eine qualitativ hochwertige NGS-Bibliotheksvorbereitung in nur 1,5 Stunden mit nur 10 Minuten praktischer Zeit.
Einige genomische Regionen lassen sich nur sehr schwer gleichmäßig abdecken, was in der Regel zu einer sehr geringen Abdeckungsrate oder Lücken in diesen Regionen führt.
Typische schwierige Regionen sind:
- mit hohem GC-Gehalt
- Sekundärstrukturen aufweisen: hauptsächlich aufgrund von Wiederholungssequenzen
- die schlimmsten Fälle: haben sowohl einen hohen GC-Gehalt als auch wiederholte Sequenzen.
Beispiel: Das menschliche TERT-Gen ist eine der schwierigsten Regionen, wie oben gezeigt. Die NGS-Daten haben gezeigt, dass das BioDynami-Kit die beste Leistung bei der Abdeckung der extrem schwierigen menschlichen TERT-Gen-Region aufweist.
Für die Kits der Illumina-Plattform sind drei Index-Typen verfügbar:
Nicht-Index: Die Bibliotheken haben keinen Index.
Index : Eine einzigartige Barcode-Sequenz mit 6 Basen wurde in jeden der Index-Primer aufgenommen.
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