Das NGS FFPE DNA Library Prep Kit (illumina- und MGI-Plattformen) wurde für den Aufbau hochwertiger FFPE-DNA-Bibliotheken unter Verwendung von 10 ng bis 400 ng Input-DNA entwickelt, die aus formalinfixierten, in Paraffin eingebetteten (FFPE) Proben isoliert wurde. Die durch die Fixierung verursachten DNA-Schäden erschweren die Konstruktion qualitativ hochwertiger Bibliotheken. Unser Kit wurde optimiert, um beschädigte DNA in den Reaktionen zu reparieren. Multiplexing der NGS FFPE-DNA-Bibliothek ist möglich.
FFPE-Proben sind eine großartige Ressource für die biomedizinische Forschung. Die Methoden zur Fixierung und die Lagerungsbedingungen schädigen die DNA in den Proben jedoch erheblich. Daher ist die Gewinnung hochwertiger DNA aus FFPE-Proben oft eine Herausforderung. Geringe Ausbeute und niedrige Qualität der FFPE-DNA sind aufgrund des begrenzten Gewebematerials und des DNA-Abbaus üblich.
Infolgedessen ist es in der Regel schwierig, qualitativ hochwertige NGS-Bibliotheken aus geringer Menge und Qualität von FFPE-DNA zu erstellen. Um dieses Problem zu lösen, haben wir das NGS FFPE DNA Library Prep Kit entwickelt, um qualitativ hochwertige Bibliotheken aus dem geringen Input von FFPE DNA-Proben herzustellen.
Für das NGS FFPE DNA Library Prep Kit der illumina-Plattform sind drei Index-Typen verfügbar:
Nicht-Index: Die Bibliotheken haben keinen Index.
Index : Jeder unserer Index-Primer enthält einen einzigartigen Barcode-DNA (6 Basen lang), der zur Identifizierung der einzelnen Bibliothek verwendet werden kann. Das Multiplexing von Bibliotheken ist bis zu 48 Proben möglich. Index-Informationen können hier heruntergeladen werden.
Einzigartiger Doppelindex: Das Multiplexing von FFPE-DNA-Bibliotheken ist mit 96 Proben auf der Grundlage des einzigartigen dualen Indexierungssystems möglich.
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