Reagenz / als Lösung 30075S

NGS

Die Multiplexing Unique Dual Index Primers enthalten eine Primermischung für das Multiplexing von Proben für Next Generation Sequencing (NGS) auf der illumina-Plattform. Das Multiplexing von NGS-Proben senkt die Sequenzierungskosten, indem mehrere NGS-Bibliotheken in einer einzigen Fließzellen-Lane zusammengefasst werden. Wir haben ein Vier-Basen-Differenz-Indexsystem entwickelt. Mit diesem System können wir Indizes erstellen, die sich in der Indexlänge von 8 Basen um mindestens 4 Basen voneinander unterscheiden. Unsere einzigartigen dualen Indexierungsprimer beseitigen Sequenzierungsfehler wie Index-Hopping, Index-Kreuzkontamination, Fehlzuordnung von Reads, Amplifikationsfehler und De-Multiplexing-Fehler. Merkmale Verbessert die Spezifität der Probenidentifizierung durch das 4-Basen-Differenzindexsystem Jeder Index hat mindestens 4 Basen, die sich von anderen Indizes unterscheiden die 4-Basen-Differenz erhöht die Spezifität im Vergleich zur 3-Basen-Differenz der anderen Anbieter erheblich. Erhöht die Multiplexing-Kapazität 96 vorgemischte einzigartige Paare von i5- und i7-Index-Primern Minimiert Sequenzierfehler wie z.B.: Index-Hopping Index-Kreuzkontamination Falsche Zuweisung von Reads Amplifikationsfehler De-Multiplexing-Fehler Identifizierung von Index-Hopping durch Unique Dual Index. 96 Bibliotheken wurden mit dem BioDynami NGS DNA Library Prep Kit und den BioDynami Multiplexing Unique Dual Index Primern hergestellt. Die Bibliotheken wurden in gleicher Konzentration gepoolt und auf dem Illumina HiSeq 4000 sequenziert. Die Anzahl der Reads aus allen Bibliotheken wurde demultiplexiert und analysiert. Demultiplexiert: korrekte i5- und i7-Indexkombination Identifiziertes Index-Hopping: korrekte Barcodes, aber NICHT korrekte i5- und i7-Indexkombination Sonstige: passt nicht in die oben genannten Kategorien